بیمارستان ها به محل پرورش گونه های جدیدی از میکروب ها تبدیل شده اند. در مطالعه ای که اخیرا توسط تیمی از دانشگاه Basel در سوئیس انجام گرفت، بیش از 30 گونه باکتری ناشناخته که در محیط بیمارستان وجود داشتند شناسایی شد، برخی از آنها نقش مهمی در مراقبت های بهداشتی بالینی دارند.
این کشف از سال ها جمع‌آوری و تحلیل دقیق میکروب های ناشناخته، که معمولاً در بیمارستان ها یافت می شود، سرچشمه می‌گیرد و دنیای پیچیدۀ عفونت‌های باکتریایی و درمان‌های آن را آشکار تر می سازد.
در دل این تحقیق، نیاز به شناسایی دقیق باکتری‌های عامل عفونت جای گرفته است. روش‌های استاندارد آزمایشگاهی، مانند طیف‌سنجی جرمی یا توالی‌یابی جزئی ژنوم، معمولاً کافی هستند. با این حال، این روش‌ها گاهی اوقات جوابگو نیستند، بالاخص وقتی که باکتری‌های مذکور طبقه‌بندی نشده‌اند یا کشت‌شان دشوار است.
از سال 2014، تیمی اختصاصی در دانشگاه بازل و بیمارستان دانشگاه بازل نمونه‌های بیمارانی را جمع‌آوری می‌کنند که ناقل این میکروب‌های ناشناخته بودند. دانشمندان با تلاش‌های خود 61 عامل بیماری‌زای باکتریایی ناشناخته را تحلیل کردند که در نمونه‌های خون یا بافت بیمار یافت شده بودند. این نمونه‌ها شرایط پزشکی مختلفی را در بر می‌گرفتند که نمی‌شد با روش‌های آزمایشگاهی مرسوم این دسته باکتری‌ها را در آنها شناسایی کرد.
چنین پیشرفتی با تعیین توالی ژنتیکی کامل این باکتری‌ها حاصل شد، روشی که در سال‌های اخیر در دسترس قرار گرفته است. این رویکرد جامع به تیم اجازه داد تا با استفاده از ابزاری آنلاین کل ماده ژنتیکی باکتری را با سویه‌های شناخته شده مقایسه کند.
از 61 باکتری مورد آزمایش شده، 35 باکتری برای علم کاملاً جدید بودند. شناسایی 26 سویه باقیمانده، یا به دلیل افزوده‌های اخیر به پایگاه‌های اطلاعاتی ژنومی یا اضافه شدن توصیف‌هایی به طبقه‌بندی اخیر، دشوار بود. محققان 7 سویه از 35 سویه جدید را «از نظر بالینی مرتبط» در نظر گرفتند، به این معنی که می‌توانند باعث عفونت در انسان شوند.
همچنین بخوانید >> کشف باکتری جدید عامل ایجاد پوسیدگی دندان توسط دانشمندان
دکتر Daniel Goldenberger، نویسنده این مطالعه، میکروبیولوژیست در دانشگاه بازل، در نشستی آکادمیک بیان داشت: «چنین پیوندهای مستقیمی بین گونه‌های تازه شناسایی‌شدۀ باکتری‌ها و ارتباط بالینی آنها به‌ندرت در گذشته منتشر شده است.»
بسیاری از گونه‌های جدید بخشی از جنس Corynebacterium و Schaalia هستند که انواع باسیل‌های گِرم مثبت هستند. این باکتری‌ها اغلب در میکروبیوم طبیعی پوست و مخاط انسان یافت می‌شوند که چندان جدی گرفته نمی‌شوند و پژوهش‌ها در اینباره محدود است. این باکتری‌ها می‌توانند باعث عفونت شوند، بالاخص هنگام ورود به جریان خون، مثلاً به‌خاطر تومور.
از جمله کشف‌های برجسته نوعی پاتوژنی غیرقابل شناسایی بود که در شست ملتهب بیمار پس از گاز گرفتن سگ یافت شد. این باکتری که گروه تحقیقاتی دیگری از کانادا نیز آنرا در زخم‌های مشابه یافته بودند، Vandammella animalimorsus نامیده شده است که نشان‌دهندۀ ارتباط آن با گاز گرفتگی حیوانات است. این پاتوژن در حال حاضر در قالب پاتوژنی در حال ظهور در نظر گرفته می‌شود که بررسی بیشتری را می‌طلبد.
تیم دانشگاه بازل در حال همکاری با پروفسور Peter Vandamme، متخصص طبقه‌بندی باکتری‌ها از دانشگاه Ghent، برای نامگذاری این گونه‌های جدید است. Pseudoclavibacter triregionum یکی از آنهایی است که قبلاً نامگذاری شده است، این نام اشاره‌ای به موقعیت مرزی خاص دانشگاه بازل در سه نقطه در نزدیکی سوئیس، فرانسه و آلمان است.
این پروژه نوآورانه همچنان در حال اجراست و تیم به جمع‌آوری و توالی‌یابی پاتوژن‌های ناشناخته از نمونه‌های بیمار ادامه می‌دهد.
دکتر Goldenberger توضیح می‌دهد: «ما متوجه مناسباتی بزرگ شده‌ایم: به لطف پیشرفت‌های فناوری در حوزۀ باکتری‌شناسی، اطلاعات بیشتری درباره گونه‌های تازه کشف‌شده باکتری منتشر می‌شود.»
این مطالعه در مجله BMC Microbiology منتشر شده است.
ترجمه و بازنویسی شده توسط مجله پزشکی سلام